在費了九牛二虎之力好不容易打敗了神秘客之后，蜘蛛俠彼得·帕克（湯姆·赫蘭德 Tom Holland 飾）卻被瀕死之際的神秘客揭露了真實身份。隨后主流媒體對超能力者濫用權力造成普通平民生活無數困擾的行為大加撻伐，一時間彼得的生活亂作一團，甚至影響到了MJ（贊達亞 Zendaya 飾）和好朋友內德（雅各布·巴特朗 Jacob Batalon 飾）的生活。備受困擾的彼得找到了奇異博士（本尼迪克特·康伯巴奇 Benedict Cumberbatch 飾），希望對方施展一條能夠讓世人忘記他真實身份的咒語。誰知亂中出錯，這條咒語將其他宇宙中認識彼得·帕克的人陸續帶來，其中包括章魚博士、綠魔、沙人等其他蜘蛛俠的死對頭。